프런티어 브레인이란 각 지방마다 있는 배틀프런티어 시설에서 등장하는 인물의 칭호를 말한다.
프런티어 브레인과 직접 만나려면 각 시설에서 등장하는 포켓몬 트레이너들과 배틀하여 연승을 해야 한다.
브레인과의 배틀에서 승리할 경우 BP를 일반 트레이너들이 주는 것보다 더 많이 획득할 수 있다. 또한 연승을 하게 될 경우 3세대는 심볼을, 4세대는 프린트가 주어진다.
브레인에게는 각각 특별한 칭호가 존재하며 건물 외부, 내부가 특이한 것을 볼 수 있다. 예를 들면 3세대 브레인인 기선은 피라미드킹이라는 칭호를 지니고 있고 건물 형태도 피라미드 형식이다. 또 4세대 브레인인 달리아는 룰렛여신이라는 칭호를 지니고 있고 그녀가 춤을 좋아하기 때문에 건물 내부가 나이트 분위기를 낸다.
5세대는 배틀서브웨이, 6세대는 배틀샤틀레느로 등장한다.
게임에서의 등장[]
 호연 배틀프런티어
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 신오·성도 배틀프런티어
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| 배틀서브웨이 | |||||
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 배틀하우스
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애니메이션에서의 등장[]
포켓몬스터 AG에서 호연지방의 브레인들이 등장하였는데 지우가 배틀프론티어 재패를 다루기때문에 전원이 등장하였다.
신오지방의 브레인은 포켓몬스터 DP의 떡잎축제에서 종수가 등장하였다. 카틀레야도 포켓몬스터 베스트위시 시즌2에서 등장하지만 하나지방의 사천왕 자격으로 등장하였다.
하나지방의 배틀서브웨이는 포켓몬스터 베스트위시에서 상행, 하행이 등장하였다. 이들은 철도 연맹에 가입하여 덴트와는 이미 아는 사이로 등장했다.