전작과 달라진것 없이 켈리몬 형제가 운영하는 상점이다. 왼쪽의 초록색 형 켈리몬은 음식, 구미, 씨앗등을 판다. 오른쪽의 보라색 동생 켈리몬은 이상한 구슬, 기술머신등을 판다.
해골몽 은행[]
전작에서는 페르시온이 운영했으나 해골몽으로 주인이 바뀌었다. 탐험대가 던전에서 쓰러진 후 마을로 귀환하면, 소지한 돈은 사라지는데 은행에 맡긴 돈은 사라지지 않는다.
캥카 아줌마의 창고[]
이 부분의 본문은 캥카 아줌마의 창고입니다.
캥카 아줌마가 운영하는 창고이다. 이 곳에서는 각종 도구들을 맡길 수 있다. 플레이어의 랭크가 올라가면 창고의 크기도 함께 커진다. 참고로 탐험대가 던전에서 쓰러진 후 마을로 귀환하면, 소지한 도구들은 모두 잃어버리지만, 창고에 맡긴 도구들은 사라지지 않는다. 스토리 도중 캥카 형태의 동상이 던전 앞에 있는 경우가 있는데 그것을 통해 창고에 보관할 수도 있다.
텅구리 도장[]
텅구리가 운영하는 도장이다. 기본 10개의 방과 1회차 이후에 등장하는 마지막 방, 그리고 통신등을 통하여 등장 시킬 수 있는 탐험대의 방이 있다. 1~2개의 타입이 하나의 방을 이루며 2~3종류의 포켓몬이 등장한다. 텅구리 도장에서는 도구와 포켓을 가져갈 수 없으며 마지막 방에서는 10개의 방에서 출현하는 포켓몬들이 전부 등장한다. 마지막 방의 특정 층에서 지라치, 스이쿤, 파이어가 등장하며 첫 돌파시 텅구리에게 포켓몬에게 지닐 시 모든 스탯을 올리는 브라운리본을 받을 수 있다. 이전에 한번 망했다 다시 부활했다고 한다.
돌보미집 럭키[]
시간·어둠의 탐험대부터는 의뢰의 보수로 알을 입수할 수 있는데. 알은 자동으로 럭키의 돌보미집으로 보내진다. 보내진 알은 던전을 5번 클리어하면 부화하는데 특정 던전의 기본포켓몬중 하나가 등장하며, 유전기(알기술)을 배울 수 있다.
에레키블 링크샵[]
에레키블이 운영하는 샵이다. 이 곳에서는 500포켓에 기술 두개를 조합하여 연결 기술을 만들거나 해제 시켜준다. 또한, 잊어버린 레벨업 기술을 가르쳐 주기도 한다. 단, 유전기(알기술)는 다시 배울 수 없다.
네이티오 감정소[]
주인공과 파트너가 안개 호수로 원정을 다녀오고 나면 네이티오가 상점을 여는데. 150포켓을 지불하고 던전 안에서 주운 보물상자의 내용물을 감정해 주는 시설이다. 상점에서 열어주는 보물상자에는 각 포켓몬의 전용도구나 기술머신 등이 들어있다. 획득한 전용도구를 세트로 모을 경우 길드 지하 2층에서 삐딱구리에게 포켓을 지불하고 희귀함이 높은 도구로 교환할수 있다.