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마지막에는 뮤츠를 만나서 싸우게 된다. 다른 던전보다 몬스터소굴이 훨신 많은 편이다 그리고 맵이 매우 복잡하다. 40층부터는 동굴같이 맵이 바뀐다. 50층부터 모래바람이 시작된다.
| 포켓몬 불가사의 던전 빨강 구조대·파랑 구조대 | |
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| 구조대 기지 ᛫ 포켓몬 광장 ᛫ 메깅의 연못 ᛫ 빛의 동굴 ᛫ 패리퍼 연락소 ᛫ 마크탕 훈련소 ᛫ 친구 에리어 | |
| 1기 던전 | 소동의 숲 ᛫ (바위의 옆굴 ᛫ 눈의 옆굴)* |
| 2기 던전 | |
| 기타 던전 | 청정숲 ᛫ 멀리짖음 숲 ᛫ 사막 지대 ᛫ 남쪽 동굴 ᛫ 용소의 연못 ᛫ 비룡 언덕 ᛫ 어두운 밤의 유적 ᛫ 안농의 유적 ᛫ 넓은 바다 ᛫ 세상 끝의 바다 ᛫ 이변의 동굴 ᛫ 남겨진 섬 ᛫ 불가사의한 바다 ᛫ 환상의 해협 |