Los Pokémon y los personajes que conocemos solo son algunos de los que Game Freak creó, por esto, hay algunos Pokémon que nunca aparecieron en los videojuegos, anime, manga o TCG. Estos Pokémon son denominados Pokémon beta, pues, al igual que los objetos beta sólo están en las versiones beta de los videojuegos. Sin embargo, estos Pokémon son imposibles de conseguir, a diferencia de los objetos beta que si pueden obtenerse.
Pokémon desconocidos
Kage no mushi
Se conoce que era de tipo Planta/Bicho. Su nombre en Español sería Insecto Sombra. Era de las versiones betas de Oro y Plata. Se sabe que podía aprender gruñido, fortaleza y placaje.
Kurusu
La única información que conoce acerca de esta criatura es su nombre e imagen. En la demo de Pokémon Oro y Plata, su número en la Pokédex Nacional fue el 212. Pertenecía al tipo agua y conocía los movimientos gruñido, placaje y pistola Agua.
Honoguma
Se saben pocas cosas sobre él. Su nombre proviene de la combinación de Hono (llamas) y Kuma (oso). Tiene casi las mismas características de Raichu. En las versiones betas de Oro y Plata, este era de tipo fuego y conocía los ataques malicioso, arañazo y ascuas.
Pokémon sin nombre
A este Pokémon no se le dio nombre. Su apariencia es como una mezcla de Clefable y Hitmontop, aunque Hitmontop tiene el eje rotativo en la cabeza y este lo tiene en la parte inferior de su cuerpo.
Tortuga sin nombre
A este Pokémon no se le dio nombre. Se parece mucho a Tirtouga, pero se desconoce su tipo.
Pokémon en su forma beta
Otros modelos de Pokémon que ya existen pero distintos como los conocemos ahora.
Primera generación
Blastoise y Staryu
Se puede ver que Blastoise tenía unas orejas más grandes de las que tiene ahora, era más pequeño, tenía varias decoraciones en sus brazos en forma de triángulo y no tenía los dos cañones de agua de su lomo. Staryu tiene una decoración diferente que tiene alrededor de su perla central.
Weedle
Una versión beta de Weedle. Es uno de los muchos sprites que salieron en la web de Game Freak. Su nombre era Kokana.
Kakuna
Es la evolución de Kokana. Es uno de los muchos sprites que salieron en la web de Game Freak. Luego fue reemplazado por Kakuna. Su nombre era Kasanagi.
Beedrill
La evolución de Kasanagi. Es uno de los muchos sprites que salieron en la web de Game Freak. Como Kasanagi, este Pokémon fue reemplazado por Beedrill, y tiene un parecido con Ledian. Se desconoce su nombre.
Poliwag
Una versión beta de Poliwag. Es uno de los muchos sprites que salieron en la web de Game Freak.
Poliwrath
Una versión beta de Poliwrath. Es uno de los muchos sprites que salieron en la web de Game Freak. Su nombre era Nyosuka.
Dragonair
Una versión beta de Dragonair. Es uno de los muchos sprites que salieron en la web de Game Freak.
Segunda generación
Chikorita
Los cambios apreciables son que tiene un tipo de orejas en su cabeza, a parte de que es más pequeño de lo que es ahora y pierde el cuerpo, las piernas traseras y cola. Su nombre era "Happa", que significa hoja. Era más pequeño que los otros dos iniciales de la 2ª generación: Totodile y Cyndaquil.
Tercera generación
Torchic
Los cambios que se aprecian en esta versión beta era que tenía una especie de orejas en la cabeza bastante grandes y un pequeño trozo de plumas amarillas detrás de su cabeza.
Treecko
Los cambios que se pueden apreciar es que tiene dos hojas en cada brazo (como su evolución Grovyle), la cabeza es un poco más pequeña y la cola no es doble.
Blaziken y Latias
Es un único Pokémon, pareciéndose mucho a Blaziken y Latias. No se sabe su nombre real, aunque podría ser que a partir de este Pokémon crearan a Latias y a Blaziken. Montada, hay una entrenadora desconocida, aunque se parece mucho a Cristal.
Wynaut
En las versiones beta de Pokémon Rubí y Zafiro, Wynaut no era de color azul sino verde. Además, los símbolos de macho (♂) y hembra (♀) son del mismo color que el de macho de las versiones ya terminadas, de color azul.
Gastrodon
Según una entrevista de la revista Nintendo Power, Shellos y Gastrodon fueron diseñados para Pokémon Rubí y Zafiro, pero en las versiones finales no se incluyeron.
Quinta generación
Excadrill
Se puede apreciar que Excadrill tiene un color morado azulado en vez de marrón, y no puede ser su forma variocolor, ya que esta es de color rojizo, además sus cicatrices están invertidas.