Apareció por primera vez en Juego sucio (ES) / Un Pokémon inteligente (HA)‹№›, el Dr. Wiseman estaba tratando de capturar al Noctowl mediante trampas en lugar de Poké Balls, pero cada vez Noctowl se burlaba de él y escapaba de las trampas, generalmente dejándolo hipnotizado en el proceso. Después de que Ash lo rescatara del Team/Equipo Rocket, Ash y Pikachu luchan contra él y Ash lo capturó, añadiéndolo así a su equipo.
Noctowl fue utilizado en la misma forma que Ash usaba a Pidgeotto, enviándolo a buscar a los Pokémon robados por el Team/Equipo Rocket. Por alguna razón, a menudo se ausenta en algunas escenas con el resto del grupo de Pokémon.
Noctowl, sin embargo, es único en comparación con otros Pokémon voladores porque usa poderes psíquicos.
Es el único Pokémon que Ash capturó en Johto contra el que tuvo que luchar ya que Heracross y Chikorita se fueron con él voluntariamente, Cyndaquil fue atrapado cuando se distrajo , Phanpy nació de un Huevo y a Totodile lo consiguió luego de tener una batalla con Misty porque no sabían quién lo había capturado.