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Los lugares especiales de aparición de Pokémon, también conocidos como fenómenos, es una mecánica de juego introducida en la quinta generación que permite conseguir Pokémon salvajes y objetos de una forma inusual y aleatoria. A partir de la sexta generación, los encuentros con Pokémon en estos fenómenos son llamados emboscadas. Existen diferentes tipos de emboscadas dependiendo de la zona y algunos Pokémon sólo se pueden conseguir mediante este método.
En los juegos de la quinta generación los fenómenos sólo aparecen una vez que el jugador obtiene su primera medalla. Los fenómenos siguen existiendo incluso si el jugador se retira de la zona que rodea al fenómeno (pero no completamente) o entra a los menús. No desaparecen a menos que al jugador lo reten a un combate, consiga un objeto, interactúe con una persona o se vaya completamente de la zona. Si una persona (que no sea el jugador) pasa por él, desaparecerá. No puede haber más de un fenómeno a la vez en una misma zona. Si se guarda la partida y no se consigue el Pokémon deseado, una vez prendida nuevamente la consola, el fenómeno habrá desaparecido. Una forma de saber si está ocurriendo un fenómeno es si se escucha un sonido aparte de la música de la zona, aunque una señal también será visible.
En la hierba que se mueve (Rustling grass en inglés) se pueden encontrar Pokémon.
En la quinta generación, Audino se puede encontrar en, prácticamente, cualquier ruta de Teselia (la única ruta en la que no se encuentra Audino es en la ruta 19). Algunos otros Pokémon se pueden encontrar mediante este método, como, por ejemplo, el trío de monos en el Bosque de los Perdidos y en el Bosque Azulejo (sólo en Pokémon Negro y Blanco), aunque siempre con una menor probabilidad que Audino. Este fenómeno no puede ocurrir en hierba oscura, pero sí en hierba muy alta. Los Pokémon varían dependiendo si el jugador tiene o no la Pokédex Nacional en Pokémon Negro y Blanco.
En la séptima generación cuando el jugador se acerca lo suficiente a la hierba que se mueve el Pokémon que se encuentra oculto lo persigue para atacarlo. Algunas veces cuando dicho Pokémon es atrapado o derrotado suelta un objeto.
Las nubes de polvo (Dust clouds en inglés) aparecen en las cuevas.
En la quinta generación dentro de la nubes de polvo pueden aparecer tanto Pokémon como objetos (como, por ejemplo, gemas, piedras evolutivas y partes). Siempre hay un 40% que sea un Pokémon y un 60% que sea un objeto. Llevar un repelente activado, sin embargo, evita o reduce la posibilidad de que aparezcan Pokémon y, en su lugar, salen objetos.
En la séptima generación las nubes de polvo ocultan Pokémon los cuales persiguen al jugador para combatir.
Las sombras de Pokémon (Pokémon's shadow en inglés) indican Pokémon en las alturas.
En la quinta generación en las sombras de Pokémon pueden aparecer tanto Pokémon voladores como objetos (como, por ejemplo, plumas). Este fenómeno se da sólo en el Puente de Fayenza y en el Puente Progreso. Siempre hay un 40% que sea un Pokémon y un 60% que sea un objeto.
En la sexta generación aparecen sombras de Pokémon en las cuevas. Cuando el jugador camina sobre estas, los Pokémon caen del techo para atacar. También aparecen sombras en algunas zonas abiertas de las cuales descienden Pokémon.
Las sombras del agua (Rippling water en inglés) en la quinta generación indican la presencia de Pokémon, nunca objetos. Estos Pokémon se pueden encontrar haciendo surf sobre las sombras o pescando en ellas.
En la séptima generación estas sombras están asociadas a burbujas y en ellas pueden aparecer tanto Pokémon como objetos. Únicamente aparecen Pokémon pescando en ellas y si el jugador se acerca demasiado puede ahuyentar al Pokémon.