Flauta eón (Eon Flute en inglés y むげんのふえ en japonés) es un objeto clave introducido en la sexta generación, en los juegos Pokémon Rubí Omega y Pokémon Zafiro Alfa. Aún se desconoce su obtención en el juego. Guarda relación con Mega-Latios y Mega-Latias.
Función
La flauta eón sirve para activar la función Ultravuelo tras megaevolucionar a uno de los Pokémon eón. Al activar dicha función, se podrá recorrer libremente los cielos de Hoenn a lomos de dichos Pokémon legendarios, podiendo encontrar los Parajes Espejismo, sólo accesibles mediante esta función. Allí podremos encontrar Pokémon legendarios de otras regiones.