El Desierto Haruba (Haruba Desert en inglés y ハルバさばく en japonés) es un gran desierto donde se te asigna la misión de conseguir la última Gema: la Gema ambarina. En este Desierto se encuentra el Templo Hippowdon. Cresselia es quien protege la gema ambarina. Deberás tener cuidado con los Skorupi que saltan de los huecos y pueden sorprenderte, aunque son inofensivos. Después, cuando llegues a la entrada del Templo Hippowdon, baja las escaleras de la derecha para poder capturar a Hippowdon y así usar su movimiento de zona para llenar el foso y poder entrar al templo, pero cuidado con éste ya que provoca remolinos y es difícil capturarle. Cuando entres comenzará la misión y poco después recibirás un correo de voz de Silvio. Deberás ir a ayudarle.