Una de las funciones del juego es ir completando la Pokédex a medida que se capturan Pokémon en el mapa. Actualmente se encuentran disponibles gran parte de los 386 Pokémon de la primera generación, segunda generación y tercera generación, a excepción de algunos Pokémon legendarios de cada generación y de varios Pokémon que aún no han aparecido. Los Pokémon se pueden conseguir capturándolos a medida que aparecen en el mapa, o incubando los huevos que podemos obtener en las Poképaradas.
Ditto fue agregado en noviembre de 20161 y aparece transformado en otro Pokémon como Pidgey, Rattata, Zubat, Gastly, Sentret, Yanma, Hoothoot, Zigzagoon, Taillow, Whismur o Gulpin.
Los Pokémon legendarios, al tratarse de criaturas extremadamente raras y poderosas, en Pokémon GO solo aparecen como jefes de incursiones en los gimnasios, con un grado de dificultad 5, y por un tiempo limitado. Una vez son vencidos en combate pueden ser capturados usando Premier Balls. Lugia y Articuno fueron los primeros legendarios en ser desbloqueados tras el evento del Pokémon GO Fest en Grant Park, el 22 de julio de 2017.
Hay algunos Pokémon que además son exclusivos de diferentes regiones y no aparecerán de forma salvaje fuera de esa región:
Esta es la lista de los Pokémon regionales y donde pueden ser capturados en estado salvaje:
- Tauros: solo aparece en los Estados Unidos y Canadá.
- Mr. Mime: solo aparece en Europa.
- Farfetch'd: solo aparece en Asia Oriental.
- Kangaskhan: solo aparece en Australia.
- Heracross: solo aparece en América del Sur, América Central, México y el sur de los Estados Unidos.
- Corsola: solo aparece en la zona intertropical.
- Illumise, Seviper y Solrock: solo aparecen en América y África.
- Volbeat, Zangoose y Lunatone: solo aparecen en Europa, Asia y Oceanía.
- Relicanth: solo aparece en Nueva Zelanda y deteminados territorios de la Melanesia (Fiyi, Vanuatu y Nueva Caledonia).
- Torkoal: solo aparece en Asia Occidental (Emiratos Árabes Unidos), Asia del Sur (India) y el Sudeste Asiático (Indonesia y Tailandia).
- Tropius: solo aparece en África y el norte del Mar Mediterráneo.
Los Pokémon salvajes suelen aparecer con mayor frecuencia en zonas con gran concurrencia de público, tales como parques o centros comerciales. Adicionalmente se puede propiciar la aparición de Pokémon mediante el uso de objetos como inciensos o módulos cebo.
Los Pokémon que aparecen en el mapa, excepto si aparecen a raíz de usar un incienso, aparecerán normalmente a todos los jugadores que se encuentren cerca. Sin embargo, los puntos de combate (PC) del Pokémon dependerán del nivel de cada jugador.
Cuando un Pokémon aparece en el mapa, el dispositivo del jugador vibra (siempre que se tenga activada la opción de vibración en los ajustes). Entonces es necesario pulsar sobre el Pokémon para entrar en el modo de captura. En la pantalla aparecerá un texto con el nombre del Pokémon y sus puntos de combate (PC). Si los PC del Pokémon son más altos que cualquiera de los Pokémon que hemos capturado, no los mostrará y en su lugar solo aparecerán unos interrogantes (PC¿?). El jugador debe orientar la cámara (si tiene activada la función de realidad aumentada), apuntar al Pokémon y lanzar la Poké Ball, deslizando el dedo desde la Poké Ball hacia arriba.
No todas las veces que se atrapa un Pokémon resulta exitosa la captura. Según los puntos de combate (PC) del Pokémon en cuestión, este puede escapar de la Poké Ball obligando a lanzar de nuevo otra. A veces, tras varios escapes consecutivos, el Pokémon termina huyendo. En estos casos es recomendable usar una Baya Frambu o Poké Balls de mayor eficacia para aumentar la probabilidad de captura. A veces, de forma aleatoria, se puede ocasionar una captura crítica al momento de atraparlo.
En cada captura, además de experiencia, se obtienen 100 polvoestelares y 3 caramelos de la especie básica (no evolucionada) del Pokémon que hemos atrapado.
A la hora de atrapar un Pokémon habrá que tener en cuenta varios aspectos:
- Color del aro de precisión
- Este aspecto suele estar relacionado con el nivel de PC que tiene el Pokémon, y con la frecuencia de aparición. A mayor nivel de PC o mayor rareza, más oscuro será el aro, y mayor será la probabilidad de que la captura resulte fallida y se necesite otra Poké Ball para atrapar al Pokémon. Cambiando a una Poké Ball más potente (Super Ball y Ultra Ball) es posible aumentar la probabilidad de éxito de la captura.
- Verde: muy alta probabilidad de éxito en la captura.
- Amarillo: alta probabilidad de éxito en la captura.
- Anaranjado: probabilidad normal de éxito en la captura.
- Rojizo: baja probabilidad de éxito en la captura.
- Tamaño del aro
- Aquí es donde interviene la habilidad del jugador. Según el tamaño del mismo se pueden obtener bonus de experiencia: 10 PX (Bien), 50 PX (Genial) e incluso 100 PX (Excelente) dependiendo del tamaño del aro que haya sido golpeado por la Poké Ball.
- Distancia
- Otro aspecto a tener en cuenta es la distancia a la que se encuentra el Pokémon, la cual determina la fuerza con la que se debe lanzar la Poké Ball.
- Movimiento-actitud
- La actitud del Pokémon al que se va a atrapar también habrá que tenerla en cuenta para ahorrar Poké Ball y no desperdiciarlas. Se debe lanzar la Poké Ball cuando el Pokémon esté quieto, pues a veces realizan algún ataque o movimiento, que no causará daño, pero hará que la captura falle automáticamente (la Poké Ball ni siquiera se abrirá), y normalmente salga despedida fuera de la pantalla, impidiendo que se puede recuperar.
- Bola curva
- Se puede conseguir si se dibuja una curva con el dedo durante el lanzamiento. La bola curva aumenta la probabilidad de captura. Además con ello se obtienen 10 PX extra como mínimo en el lanzamiento al golpear el aro (es una técnica que requiere experiencia y práctica y que obligará al jugador a perder más de una Poké Ball en los ensayos. Aún así no siempre que se lanza una bola curva se obtiene la bonificación). Unas estrellas y destellos que rodean a la bola durante el vuelo en el aire, además del giro sobre si misma que sufre por el efecto, y la curva que experimenta en su trayectoria, son aspectos que indican que se trata de una 'bola curva'.